Біологічні науки/9.
Біохімія і біофізика
Богайчук
І.В. 1, Козій М.І. 1, Коржов В.І.2
1Національний технічний університет України
«Київський політехнічний інститут»,
Факультет біомедичної інженерії
2ДУ «Національний інститут фтизіатрії і пульмонології імені Ф. Г.
Яновського» НАМН України
АНАЛІЗ ТА
УЗАГАЛЬНЕННЯ ВЛАСТИВОСТЕЙ АНТИФРИЗНИХ БІЛКІВ
Анотація. Робота присвячена аналізу даних про походження антифризних
білків, їх поширення, властивості і особливості функціонування. Також розглянута
перспектива розвитку, вивчення та застосування антифризних білків в сучасній
медицині, зокрема в кріоінженерії.
Вступ.
Антифризні білки, або антифризні
глікопротеїни, є важливими елементами низькотемпературної адаптації. Необхідна
для процесу концентрація антифризних протеїнів у 300-500 разів нижче, ніж інших
антифризних речовин. Здатність перебувати у вільному стані у водних розчинах, а
потім необоротно зв'язуватися з водою в її твердому стані є визначальною
фізичною властивістю антифризних білків [1].
Адсорбція антифризних глікопротеїнів на
поверхні льоду призводить до різниці між температурою замерзання і температурою
плавлення, або термогістерезису, а також гальмування рекристалізації льоду.
Термогістерезисна, або антифризна, активність глікопротеїнів – це здатність
знижувати температуру замерзання розчину без істотного впливу на температуру
плавлення. Встановлено, що для термогістерезисної активності необхідне
виконання наступних умов, а саме:
1) високий вміст аланінових залишків, що забезпечують спіральну
комфортацію;
2) гідрофобна поверхня повинна взаємодіяти з поверхнею кристала
льоду;
3) наявність заряджених полярних амінокислотних залишків,
відповідаючих за розчинність і/або взаємодію з решіткою льоду;
4) мінімальна довжина ланцюжка в 25 амінокислотних залишків [3, 4].
Гальмування рекристалізації льоду
дозволяє зменшити механічне пошкодження тканин, перешкоджаючи термодинамічному
зумовленому процесу безперервного зростання великих кристалів льоду за рахунок
більш дрібних в процесі заморожування.
Матеріали
і методи. При виконанні даної роботи
використовувався комплексний метод досліджень, а саме: аналіз та
узагальнення отриманих на даний момент
наукових знань про клас антифризних білків, опрацювання інформаційної бази
проведених досліджень на основі живих організмів. Аналітико-синтетична обробка
документації дала змогу якісніше оцінити отримані результати.
Результати
та їх обговорення. Антифризні білки
– один із трьох класів білків, які контролюють процеси нуклеації та
рекристилізації. Вони синтезуються в організмі пойкілотермними організмами при
холодовому стресі. Дані білки мають різне еволюційне походження, структуру,
механізми регуляції, проте всім їм властива особливість адсорбуватися на
поверхні кристалів льоду та модифікувати їх ріст [2]. Антифризні протеїни
поділяються на три групи за ефективністю їх дії. На відміну від більшості
розчинних речовин, які витісняються фронтом льоду в процесі заморожування,
антифризні білки необоротно зв’язуються з поверхнею льоду і включаються до
складу його кристалічної решітки. Вважають, що зв'язування з льодом
відбувається в 2 етапи:
1) освоєння поверхні, за яке відповідальні ділянки ланцюга,
що утворюють водневі зв'язки;
2) встановлення ван-дер-ваальсової взаємодій між
амінокислотними залишками, що збільшує силу зв’язку білок-лід.
Процес
стабілізується за рахунок стратегічно розташованих відповідно до решітки льоду
амінокислотних залишків [4].
Пошук загального механізму зв'язування антифризних білків з
льодом ускладнений варіабельністю структури цих білків і тим, що вони
розпізнають різні за структурою поверхні кристала льоду. Проте деякі загальні
властивості і закономірності були виявлені, зокрема: сайти зв'язування з
льодом, як правило, плоскі, відносно гідрофобні і займають більшу частину
поверхні білка [1,5].
Більшість антифризних протеїнів мають множинні ізоформи,
гени даних білків є представниками сімейств родинних генів, окремі представники
цих родин можуть по-різному представлятися в певних частинах організму або
окремих тканинах. На рівень активності даних білків впливають як фактори
зовнішнього середовища, так і чинники, які залежать від самого організму, у
тому числі гормони та стадія розвитку. До внутрішніх факторів також
відносяться: кількість генів та ізоформи антифризних протеїнів, їх
концентрація, кількість повторів структурних
елементів сайту зв'язування льоду, наявність інших білків, що виступають у ролі
підсилювачів .
Еволюція антифризних глікопротеїнів характеризується
виникненням неспоріднених типів антифризів всередині одного і того ж таксона, а
також конвергентної еволюцією, при якій подібні структури з'являються у
віддалених видів. Дивовижне розмаїття антифризних білків поряд з дуже вузьким
поширенням всередині таксонів призвело до гіпотези про те, що такі типи білків виникли
незалежно один від одного під час недавніх з точки зору геологічної історії подій
охолодження і заледеніння, після того як сформувалися сучасні види тварин і
рослин. Ще однією причиною розмаїття антифризних білків може бути те, що
кристал льоду має безліч поверхонь з різним геометричним розташуванням атомів
кисню. Антифризи мають два протилежні шляхи походження. Деякі з них виникли через
дегенерацію окремих членів сімейств білків, що мають абсолютно незв'язані з глікопротеїнами
функції. Інші можуть вважатися новими білками, чиї гени з'явилися внаслідок
порівняно недавніх генетичних подій . В окремих випадках дослідники припускають
горизонтальний перенос генів антифризних протеїнів між неспорідненими таксонами.
В результаті дослідження представлено існуючі знання
відносно походження, регуляції, стабільності і використання антифризних білків.
Запропонований варіант класифікації антифризних білків відносно організмів в
яких вони були відкриті. Розглянуто можливості використання антифризних білків
для захисту організму при низьких температурах.
Висновки.
Властивість антифризних білків
взаємодіяти з льодом визначає їх необхідність для організму: вони нейтралізують
нуклеатори льоду; понижують температуру замерзання рідин організму; відіграють
кріопротекторну роль по відношенню до деяких мембран та білків.
Перелік посилань
1.
Бильданова Л.Л.,
Салина Е.А., Шумный В.К. Основние свойства и особенности эволюции антифризних
белков // Вавиловський журнал генетики и селекции. - 2012. - Т.16, №1. - С.250-266.
2.
Трунова Т. И.
Растение и низкотемпературный стресс // Тимирязевские чтения. М.: Наука, - 2007. - Т. 64. - 54с.
3.
Barrett J. Thermal hysteresis proteins // Int. J.
Biochem. Cell Biol. – 2001.– Vol.33, Issue 2.– P. 105–117.
4.
Clarke C.J.,
Buckley S.L., Lindner N. Ice structuring proteins –a new name for antifreeze
proteins // Cryo Letters.– 2002.– Vol. 23, N2.– P. 89–92.
5.
Davies P.L.,
Baardsnes J., Kuiper M.J. et al. Structure and function of antifreeze proteins
// Phil. Trans. R. Soc. Lond. B.Biol. Sci.– 2002.– Vol. 357, N1423.– P.
927–935.